Tốt nghiệp đại học Y Hà Nội năm 1973 và sau đó tốt nghiệp Bác sĩ Chuyên khoa II Chuyên ngành Nhãn khoa cũng tại trường Đại học Y Hà Nội, bác sĩ Bùi Minh Ngọc đã từng công tác tại bệnh viện Đa khoa tỉnh Tuyên Quang ở cương vị Trưởng khoa Mắt trong khoảng thời gian từ năm 1974 đến năm 1981. Sau đó, bác sĩ chuyển sang công tác tại bệnh viện mắt Trung Ương và giữ vị trí Trưởng khoa Đáy mắt từ năm 1982 đến năm 2000.
Đến năm 2011, Bác sĩ Ngọc ngừng công tác tại bệnh viện nói trên và đảm nhận vị trí Trưởng khoa Đáy mắt – Bệnh viện Mắt Quốc tế DND. Bà còn vinh dự nhận danh hiệu Thầy thuốc Ưu tú vào năm 2008.
Bác sĩ Minh Ngọc có hơn 30 năm kinh nghiệm trong điều trị các bệnh nhãn khoa, đặc biệt là các bệnh liên quan đến Đáy mắt như võng mạc đái tháo đường, võng mạc cao huyết áp, thoái hóa hoàng điểm, tắc động tĩnh mạch võng mạc, bong võng mạc, viêm màng bồ đào.
Bên cạnh các hoạt động thăm khám và điều trị cho nhiều đối tượng bệnh nhân, Bác sĩ chuyên khoa II Bùi Minh Ngọc còn nhận lời tham gia các chương trình tư vấn sức khỏe trực tuyến trên đài phát thanh VOV, trả lời phỏng vấn các trang báo uy tín như Sức khỏe và đời sống, Dantri, và đều đặn viết bài nghiên cứu, báo cáo khoa học cho các tạp chí y học.